Die Fehlermeldung sagt aus, dass der Artikel bereits auf eBay vorhanden ist und Varianten hat. 
Die Fehlermeldung "Die Variante kann im beschränkten Bearbeitungsmodus nicht gelöscht werden" 
hat mit der Funktionsweise von eBay zu tun: Wenn man einen Artikel ändern will, der Varianten hat, 
muss man dabei wieder alle Varianten hochladen.

In der Praxis heißt dies, dass man Varianten im Shop nicht löschen, sondern nur die Lageranzahl =0
setzen sollte. Bitte legen Sie die gegebenenfalls fehlenden Varianten (wie auf eBay vorhanden) wieder 
im Webshop mit Lageranzahl 0 an, dann wird ein Vorbereiten und erneutes Hochladen funktionieren.